Las cárceles municipales de Jalisco están en condiciones de precariedad que favorecen situaciones de riesgo, tortura, tratos inhumanos y crueles en contra de los detenidos, en tres años se han registrado en ellas tres homicidios y 16 suicidios, ante este panorama la Comisión Estatal de Derechos Humanos Jalisco (CEDHJ) emitió una recomendación general a los 125 municipios para que corrijan sus irregularidades, y llama al Gobierno de Jalisco para que les apoye con recursos. La investigación concluye que existe falta de seguridad y hay deficiente vigilancia por parte del personal que custodia en las cárceles municipales.
